Harun bisa disebut sebagai tokoh kaum rasionais di Indonesia. Sejak menjabar Rektor IAIN Syarif Hidayatullah, Jakarta, yang merupakan perguruan tinggi bidang Studi Islam terbesar di Indonesia, ia berkonsentrasi menumbuhkan pemikiran Mu'tazilah di kalangan mahasiswanya. Ia kagum dan memuja pemikiran Mu'tazilah.